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應用rep-PCR作為院內感染AB菌株分型與比對建檔之研究

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應用rep-PCR作為院內感染AB菌株分型與比對建檔之研究

Use of rep-PCR for Molecular Genotyping and Inventory among Nosocomial Infection Associated A. baumannii Isolates

因包氏不動桿菌所引起的院內感染,尤其是具有多重抗藥的菌株,在院內傳播,已經成為醫院感染控制重要的議題。快速且正確釐清臨床菌株的分型(院內或社區),可有效控制該菌在醫院的傳播,以減少隔離病房的使用,與抗生素治療的成本。然而,傳統上透過脈衝式水平電泳(PFGE)進行分型比對,需要3至5天的時間。而重複序列基因組PCR(rep-PCR),可以透過標準化的分析過程,進行菌株的感染源比對與分型,並將分型進行資料庫倉儲(Inventory),以便未來隨時進行比對。本研究係以南部某醫學中心為例,將臨床(n=10)與環境(n=9)分離出之菌株,使用客製化之PCR套組(Welgene BioTech Co.)及毛細電泳設備(Agilent Co.),進行親源樹型圖與相似性矩陣分析。結果顯示,6個臨床菌株中相似性超過98%,且與1株自來水所分離出AB菌,有極高的相似性。本研究發現,rep-PCR可作為PFGE的替代方案,從抽取DNA至結果分析,僅需要6-8小時,與傳統PFGE相比,節省許多時間,同時其數位化輸出,可以將每次分析的菌株分型建檔,未來可快速地判別菌株的來源,有效的使用醫療資源,進行感染控制的相關措施。

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