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用固態蛋白質膠體電泳和液相層析電噴灑傅立葉轉換串聯質譜儀分析不同抗藥性克雷伯氏肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae)表現性的差異

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用固態蛋白質膠體電泳和液相層析電噴灑傅立葉轉換串聯質譜儀分析不同抗藥性克雷伯氏肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae)表現性的差異

Profiling the differences between the phenotypes of Klebsiella pneumoniae isolates via proteomics analysis

前言:克雷伯氏肺炎桿菌(簡稱KP)易被抗生素誘發突變產生多重抗藥性,造成臨床上用藥之困難。最近的研究報告指出:目前臨床上使用的抗生素導致發展出抗藥性的KP菌與莢膜抗原、脂多醣體、黏附質、膜蛋白和細胞外蛋白息息相關。所以對於KP菌的研究需要更新更有效更迅速的技術。
目的與方法:為了研究KP菌產生抗藥性的過程,採集對抗生素敏感程度不一的KP菌株,萃取其蛋白質,二維蛋白質電泳分離蛋白質,具有表現量差異的蛋白質點,回收再經胰蛋白脢切割後,透過液相層析電噴灑傅立葉轉換串聯質譜儀分析其胺基酸序列,再透過Mascot蛋白質資料庫的比對進行身份鑑定,最後以STRING與PANTHER生物資訊軟體分析。
結果與討論: 經由二維蛋白質電泳分析軟體比對後,找出12個表現量差異大於2倍的蛋白質。12個表現量不同的蛋白質當中,包括groES gene product。文獻指出groES gene product和groEL gene product可以共同組成groE operon。groES gene product,其功能用來維持細菌在高溫(42℃)下生存。osmY基因的產物是1個細胞膜和細胞壁之間的蛋白質,當osmY:TnphoA融合基因所造成的突變,將導致細菌對高張溶液壓力敏感度的上升。Succinyl coenzyme A synthetase(簡寫為SCS),SCS主要功能是將succinyl-CoA 轉化為succinate,SCS也參與citric acid cycle的催化反應。ompA蛋白質是一種outer membrane protein,而ompA的mRNA長期以來被用來做為研究regulated mRNA decay的一個實驗模型。ompA同時也會參與:1)參與biofilm 的形成;2)做為adhesin/invasin分子;3)immune evasion分子。

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