投稿分類 感控監測

主委發表種類: 口頭

投稿標題(中): 分子分型方法於偵測群突發散播菌株的實際應用分享

投稿標題(英): Practical Applications of Molecular Typing Methods in Detecting Clustered and Outbreak-Related Bacterial Strains

投稿摘要(前言): 碳青黴烯類抗生素抗藥肺炎克雷伯氏菌的出現及廣泛散播，已經成為嚴重的公共衛生議題。持續監測和即時的感控措施介入是控制其進一步傳播的重要方式之一，基於表現型的傳統分型方式，如血清型、生物型、或抗生素敏感型態，已被使用多年。然而，較新的方法能在分子層面上檢視菌株間的相關性，並已大幅提升區分的能力，我們試著比較兩種分子分型方法:細菌全基因體定序及基因外重複回文序列基因(Enterobacterial repetitive intergenic consensus, ERIC) 分型技術，與傳統透過抗生素敏感型方式及臨床病例回報在臨床實務中對偵測碳青黴烯類抗生素抗藥肺炎克雷伯氏菌群突發發生的監測效果。

投稿摘要(方法): 選定本院抗藥性細菌移生率較高之某加護病房作為研究場域，該加護病房以內科系病人為主，收集113年6月至10月有檢驗出不重複肺炎克雷伯氏菌之檢體，檢體類別包含痰液、尿液及血液，並同時監測單位耐碳青黴烯類抗生素抗藥肺炎克雷伯氏菌之移生率與醫療照護相關感染(HAI)密度。將培養的菌株分別同時送至國衛院利用次世代定序做全基因定序，定序結果以single nucleotide polymorphism (SNP)方式作分型，及國防醫學大學實驗室做基因外重複回文序列基因(Enterobacterial repetitive intergenic consensus, ERIC) 分型，與傳統透過菌株抗生素敏感型態分型及病例回報方式做比較

投稿摘要(結果): 收集的54隻中，根據全基因體定序結果，有18株具高度親緣相關性，皆為帶有KPC抗藥基因的碳青黴烯類抗生素抗藥肺炎克雷伯氏菌，而基因外重複回文序列基因(Enterobacterial repetitive intergenic consensus, ERIC) 分型也顯示一致結果，18株具高度親緣相關性菌株集中於6到8月份，回顧這段期間該病房單位的院內感染及菌株樣態，雖然肺炎克雷伯氏菌細菌移生密度有較高，但是以卡方統計與過去一年相比無顯著差異，而6至8月醫療照護相關感染亦無異常增加。而這18株中只有7株具有一致的抗生素感受性。而到11月時，該單位之醫療照護相關感染密度方才出現顯著增加。

投稿摘要(討論): 我們研究結果顯示，透過分子分型方法，不管是次世代定序方式作分型或是基因外重複回文序列基因分型方式，相較透過傳統菌株抗生素敏感分型方式，都具有更高的分型敏感性，能更早偵測出可能的群突發菌株散播，透過即時的感控措施介入，也許有機會避免後續群突發事件的發生。考量成本效益及時效性，基因外重複回文序列基因分型方式應可作為未來醫院常規監測群突發菌株的預警系統，讓我們從發現感染後處理轉變為早期偵測，以藉此降低抗藥性菌株的擴散。

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